Rabu, 04 Januari 2012

AQUACULTURE BIOINFORMATIC (TUGAS UAS TI)

MOLECULAR DETERMINATION OF A GREEN ALGAE
 ISOLATE TO DETECTING
1-Deoxy-D-Xylulose-5-phosphate Synthase (DXS)
GENE IN IMPROVEMENT OF CAROTENOID PRODUCTION
Jurnal dari molecular determination of a green algae isolate to detecting 1-deoxy-d-xylulose-5-phosphate synthase (dxs) gene in improvement of carotenoid production ( penentuan molekul dari ganggang hijau mengisolasi untuk mendeteksi 1-deoksi-D-xylulose-5-fosfat sintase (dxs) gen dalam peningkatan produksi karotenoid ) dapat di lihat klik disini

Apa itu Karotenoit ?
Karotenoid menggunakan teknologi rekayasa genetik dan rekayasa metabolit terhadap isolat alga hijau lebih lanjut memperlihatkan ketidaksesuaian hasil dengan penamaan yang ada.Determinasi spesies secara molekuler menjadi penting dilakukan untuk menentukan spesies isolat dan jalur biosintesis karotenoid yang digunakan.

Fungsi Karotenoit ?
            Fungsi biologis karotenoit  beragam dan tindakan seperti :  warna spesies tertentu, perlindungan foto, dan pemanenan cahaya, dan berfungsi sebagai prekursor hormon yang banyak.

Kegunaan karotenoid dalam isolat alga ?
Karotenoid  bias di gunakan untuk aditif makanan atau sebagai suplemen makanan dalam budidaya ikan. ganggang tersebut telah berhasil diisolasi, dimurnikan dan dimasukkan ke dalam budaya axenic. lokal isolat alga tersebut  juga akan mengikuti jalur non-MVA untuk biosintesis karotenoid. Oleh karena itu mencoba untuk memecahkan masalah ini melalui deteksi gen DXS, menggunakan pendekatan molekuler.

Pentingnya  Molekul RNA sebagai Indikator
         Di dalam Molekul RNA yang berharga sebagai indikator untuk identifikasi spesies karena rRNA adalah elemen penting dalam sintesis protein. Oleh karena itu, hadir rRNA dalam semua organisme hidup. Gen-gen rRNA mengandung urutan yang sangat dilestarikan dan daerah variabel. Fungsi lestari molekul-molekul ini telah berubah sangat sedikit selama evolusi. Jadi, rRNA bahkan dari taksonomi organisme yang paling jauh, yang berbagi hampir tidak ada homologi urutan DNA, akan memiliki urutan rRNA kesamaan, dan, karenanya, keterkaitan dapat dinilai. RNA ribosomal mungkin unik diantara makromolekul dalam hal ini. Beberapa segmen rRNA berevolusi mor cepat dari yang lain dan variasi urutan terjadi antara organisme terkait erat memungkinkan perbandingan yang akan dibuat di tingkat spesies. Filogenetik garis keturunan dapat disimpulkan dari urutan rRNA.karakterisasi 23SrRNA tersebut menunjukkan bahwa alga mengisolasi memiliki kemiripan dengan Cyanobacteria. Kesamaan terdekat dicapai oleh cyanobacterium sp. analisis fragmen putatif gen pengkodean sebuah wilayah sangat kekal di DXS dalam berbagai spesies juga dikonfirmasi hasilnya. Tingkat tinggi kesamaan itu menunjukkan antara gen DXS dari ganggang hijau mengisolasi dan Synechocystis.